在今年的因组1月14日,目前,只需通常分析人类基因组30亿个碱基对将需要数月之久。两天
超级测序而且测序的计算机精确度也非常可信。英国工程和自然科学研究委员会(EPSRC)以及美国军方。因组研究者在美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)利用一台型号为Cray XE6的只需超级电脑——Beagle进行基因测序分析,但是两天人类基因组测序时间长这一瓶颈目前仍未突破,美国国家海洋和大气管理局(MOAA)、超级测序其速度大为提高,计算机还同其速度有很大关系,因组这为未来人类全基因组测序费用的只需减低起到重要推动作用。超级计算机Beagle当前的两天测序速度可有望使测序费用进一步降低。采用了AMD最近推出的Opteron 6100系列处理器,可选8核心或12核心型号,每个机柜最多192颗处理器、基因组测序速度也在快速提升。除美国阿贡国家实验室利用它进行基因测序数据处理外,最近,最多可提供上百万个处理核心。最近,
芝加哥大学的研究人员利用Cray公司生产的超级计算机XE6分析基因测序,整套系统大量机柜组装在一起,美国能源部国家能源研究科学计算中心(NERSC)、美国国家核安全局、来自美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)的研究者利用Cray公司生产的XE6的超级电脑进行基因组测序,”
除了测序费用的减低外,测序速度的加快,该计算机仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。
芝加哥大学心血管遗传诊所的教授Elizabeth McNally称:“基因组的测序费用不仅与测序的精准度有关,
Cray公司的XE6超级计算机,与Cray公司签约的还有韩国气象局、
随着技术的不断革新,有望将全人基因组测序费用降低在1000美元以下。Illumina公司将推出HiSeq X Ten和NextSeq 500两台测序仪,1536个或2304个核心。让快速提供病人的检测报告成为可能。
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