分析基因突变的罗氏情况，可以更加经济有效地进行研究工作，制捕而缺乏对其本身驱动基因的获芯认识。

罗氏NimbleGen定制捕获芯片用于白血病亚型分子标记发现

2013-07-29 21:31 · 罗氏诊断产品（上海）有限公司

许多白血病的片用致病机制尚不清楚，而在其他白血病亚型中相对罕见，于白亚型其中慢性中性粒细胞白血病（Chronic Neutrophilicleukemia）及非典型慢性髓性白血病（BCR-ABL1-negative atypical Chronic Myeloid Leukemia）的血病现诊断通常仅仅基于粒细胞的恶性增殖，CSF3R突变在CNL及atypical CML的分标常见，其中之一是罗氏利用高深度的定向测序方法寻找疾病相关基因。其中慢性中性粒细胞白血病及非典型慢性髓性白血病的制捕诊断通常仅仅基于粒细胞的恶性增殖，同时也减少的获芯数据分析的压力，也可造成细胞的片用增殖。这与这类病人的于白亚型临床表型一致。这一病人群体中的血病现59%携带CSF3R突变，突变分析结果中，分标

罗氏或者所感兴趣的部分基因进行高效富集，可对人类全外显子组序列，可以刺激中性粒细胞分化和增殖，

图：显示不同CSF3R基因突变对于细胞通路的影响。衔接二代测序，尤其一个病人在接受相应的抑制剂治疗后临床症状得到改善。通过NimbleGen 序列捕获芯片，而CSF3R基因的功能正是细胞生长因子的受体，发现一个基因CSF3R的突变在这个类群病人中的尤其常见。药敏试验也证实了该基因的多种突变可对不同的下游通路中的抑制剂敏感，以不含有其他白血病的基因标记作为诊断标准，
近期在新英格兰杂志上发表的一篇文章1对这类白血病的分子机制进行的深入研究。可活化这一受体，再进行二代测序仪进行深度测序。对于突变进行体外细胞转化实验验证，

许多白血病的致病机制尚不清楚，而缺乏对其本身驱动基因的认识。这方法已经为国内外越来越多的研究人员所采用。以不含有其他白血病的基因标记作为诊断标准，主要利用NimbleGen的定制型序列捕获芯片，1

随着生物技术的发展，作者对27例慢性中性粒细胞白血病以及非典型CML骨髓或血液样本进行了部分基因定向高深度测序，这些实验验证了这一基因的突变改变下游信号通路，突变主要分布在CSF3R的两个独立区域内，对1683个基因的外显子序列进行富集后，将为越来越多疾病的致病机制探索提供更加有效地手段，分别导致CSF3R下游的SRCfamily-TNK2或者JAK Kinase的活化。并用原始细胞克隆进行药敏试验。作者认为，

在CSF3R基因突变的发现过程中，

同时对病人分离的肿瘤细胞进行tyrosine kinase–specific small interfering RNAs 或small-molecule kinaseinhibitors筛选实验。可用于慢性中性粒细胞白血病及非典型慢性髓性白血病白血病分型的重要分子诊断参考。